本发明公开了一种利用稀疏矩阵特性的暗场图像储存方法，包括：(1)利用暗场成像系统对待测样品进行扫描成像；暗场成像系统包括：用于放置待测样品的三轴位移台、用于向待测样品提供倾斜照射光线的光源模块、位于待测样品正上方用于接收散射光线的成像透镜组及CCD相机；CCD相机形成的暗场图像传输给电脑进行处理，电脑还与三轴位移台连接，用于控制三轴位移台的精确移动；(2)对暗场成像系统采集的原始图像数据，使用稀疏矩阵结构选择性地进行数据压缩；(3)以行单位进行数据提取，通过搜索定位完成单行数据首尾元素的位置，从而完成整行数据的提取，进而完成最终的整体图像输出。本发明可以提高图像数据的空间储存效率和时间索引效率。