一种断路器手跳失灵时预防零序电流保护误动作的方法，包括以下步骤：在双母线接线的高压线路中，于每一条线路两侧分别配置纵联差动保护或纵联距离和零序保护，以及断路器分相操作箱；分别采集线路一侧操作箱中手跳继电器、分相跳闸位置继电器和分相合闸位置继电器的触点状态，保护装置的其它保护动作开入状态；当识别到线路一侧的断路器处于一相或两相断路器手跳失灵状态时，借助于其它保护动作开入状态和线路纵联通道，向线路中的对侧保护装置发送远跳信号、允许命令信号或停止发送闭锁信号，并指示对侧保护装置进行动作条件判定，跳开对侧断路器。本发明方法简单、代价低、克服手跳断路器失灵无法启动失灵保护所造成零序电流保护误动的缺陷。