本申请涉及一种基于安全防护的智慧能源系统及其控制方法。所述系统包括能源控制模块、调度模块、分布式供电集群模块、负荷单元和控制逻辑确定模块，调度模块，用于向控制逻辑确定模块发送携带负荷需求功率的发电功率指令；控制逻辑确定模块，用于获取分布式供电集群模块的发电功率，根据发电功率和负荷需求功率确定分布式供电集群模块、负荷单元之间的控制逻辑，得到对应控制指令，输出控制逻辑和控制指令至能源控制模块；能源控制模块，用于对控制逻辑进行恶意攻击检测；当检测通过时，根据控制指令控制分布式供电集群模块中目标分布式供电模块向负荷单元提供电力。采用本系统能够提高智慧能源系统的安全性。