本发明提供了一种改性环氧树脂涂料、疏水改性纤维增强复合材料筋及其制备方法和应用，涉及纤维增强复合材料技术领域。本发明提供的改性环氧树脂涂料，包括独立地分装的A组分和B组分，A组分包括全氟辛基三乙氧基硅烷、原硅酸四乙酯、氨水和乙醇；B组分包括氨丙基三乙氧基硅烷、正硅酸四乙酯、乙醇和环氧树脂。本发明提供的改性环氧树脂涂料直接涂覆在FRP筋表面完成对FRP筋的疏水改性，大大简化了疏水FRP筋的制备流程；氟化二氧化硅纳米颗粒的存在以及硅氧硅键的引入使得改性环氧树脂涂料形成得涂层具有优异的疏水性并牢固吸附于FRP筋表面，提高FRP筋的疏水性能。