本发明公开了一种顾及卫星偏差和载噪比弧段影响的洪水探测方法，包括如下步骤S1、读取北斗和GLONASS卫星原始观测值，S2、原始观测值的处理，S3、分别建立基于分轨道分卫星分频率的载噪比和载噪比相位差探测模型；S4、洪水探测，S5、联合两种洪水探测量对洪水进行探测的探测结果，根据探测阈值将探测结果进行标记；S6、根据探测结果进行洪水预警并将探测结果对探测模型进行更新迭代。联合北斗和GLONASS双系统联合探测，有效保证探测成功率和稳定性，通过北斗和GLONASS双系统得观测值，为后期能够轻松得转换为图像及动态显示奠定基础，能够直观获取洪水区域以及强度；同时利用新数据对探测模型进行更新迭代，更加智能化，提高模型的长期稳定性。