本申请涉及一种螺杆钻具密封传动轴总成，属于石油、天然气用井下螺杆钻具技术领域，包括：传动轴装置，其包括壳体和传动轴，壳体为空心管状结构，壳体内设有转动支撑传动轴的轴承组件，传动轴位于壳体内且可在壳体内转动；密封装置，其包括位于壳体的上端且与传动轴密封连接的上密封圈，以及位于壳体的下端且与传动轴密封连接的下密封圈，上密封圈和下密封圈之间形成润滑轴承组件的封闭油腔；压力补偿装置，其位于壳体上且与封闭油腔连通，压力补偿装置通过膨胀和收缩以平衡封闭油腔内部与封闭油腔外部的压力差。本申请实现了封闭油腔两端压力相等、封闭油腔内外压力相等，提高了密封装置的密封性能，提高了传动轴总成的使用寿命。