本发明涉及一种电动阀控制系统，包括三相电源输入模块、三相电源切换模块、人机交互模块、数据处理模块和三相电源输出模块；本发明还涉及一种电动阀控制开关仪，包括箱体、控制组件、开关组件以及上述电动阀控制系统；控制组件与人机交互模块通信连接，用于对控制开关仪进行控制；开关组件分别与三相电源输出模块、三相电源切换模块和三相电源切除模块连接。本发明实现采用临时检修电源时，通过电动阀控制系统实现电动阀门的自动开关控制，提高了阀门诊断现场工作的可靠性和安全性，提高了诊断效率。