本发明公开了一种确定河流生态流量利益相关方影响权重的方法，包括如下步骤，S1、针对目标河流所在的流域构建分布式水文模型WEP；S2、基于河流生态流量利益相关方设置多个组合情景；S3、利用分布式水文模型对所有的组合情景分别进行模拟，输出各个组合场景的河道流量结果；根据河道流量结果分别计算各个河流生态流量利益相关方对河道流量的影响值；利用影响值分别计算各个河流生态流量利益相关方对河道流量的影响权重；基于生态补偿需求，利用影响权重分别计算各个河流生态流量利益相关方的生态补偿数额。优点是：解决了河流生态流量利益相关方影响权重和生态补偿数额无法量化确定的问题。