本发明公开了一种基于气候的土壤水均衡模拟计算方法，包括：S1、构建关于气候的实际蒸散发互补关系模型，并确定不同气候模式下的实际蒸散发；S2、基于实际蒸散发，计算待研究区域的作物需水量；S3、基于待研究区域的水循环规律和作物需水量，构建土壤水均衡模型，进而确定土壤水均衡变化量。本发明充分考虑了气候对土壤水的影响，构建了关于气候的实际蒸散发互补关系模型，并基于该模型得到实际蒸散发，确定了研究区域的实际需水量，同时结合其他影响参数构建了土壤水均衡模型，进而实现了土壤水均衡的模拟计算，实现了对多层土壤含水量的实时监控，从而有利于加强区域水资源管理，合理利用降水资源和土壤水资源，缓解水资源匮乏。