本发明涉及一种配电自动化管控方法及系统，所述方法包括：获取配电网的设备拓扑信息，根据所述设备拓扑信息按照预设的目录规则生成对应的管控树；获取配电网中设备的运行数据，根据所述设备与管控树的映射关系将所述运行数据与管控树对应关联并存储；对所述设备的运行数据进行分析筛选出异常设备，并向电网监控人员终端发送所述异常设备信息以进行消缺处理；根据所述设备拓扑信息及巡检人员终端的位置生成对应的巡检线路，将所述巡检人员终端上传的缺陷与所述管控树对应关联存储；通过管控树结构实现了配电网数据的准确统计，大大降低了配电自动化管控的工作强度，可快速实现配电网的运维，有效地提高了配电自动化运行的可靠性。