本发明涉及杂交水稻选育技术领域，具体涉及一种水稻柱头大小的调查方法，该方法包括S1、在水稻盛花期的上午9：00之前或下午3：00之后采集水稻穗，在每植株中选取当日已开花1/3的主穗；用湿润的纸张包裹水稻株，将主穗带回实验室，将主穗的茎秆插在水中进行保鲜，穗子不能浸泡在水中；S2、将颖花的柱头排放在载玻片上；S3、将载有柱头的载玻片置于Leica M205FA体式显微镜下，体式显微镜连接计算机和摄像头，调节体式显微镜的焦距和光照亮度，使柱头能清晰可见，打开OPTEC数码相机软件并设置标尺，进行拍照保存；S4、操作Image‑Pro Plus软件以测量单个柱头的毛刷长度、非毛刷长度、柱头宽度以及花柱长度，完成测量，该调查方法能准确且高效地测量水稻柱头大小。