本发明涉及一种燃料电池用电极催化剂的电化学表面处理方法，属于燃料电池技术领域。所述方法如下：将分散有粉态的电极催化剂的电解质溶液放入三电极电化学处理装置中的电解池中，向所述电解质溶液中通入电化学表面处理所需的气体；使三电极电化学处理装置中的工作电极基底和电解质溶液中的一种以上处于运动状态，对所述工作电极基底施加电位，对电极催化剂进行电化学表面处理；电化学表面处理结束后，采用固液分离的方式从电解质溶液中分离出电极催化剂，并对电极催化剂进行清洗、干燥，得到表面处理后的电极催化剂。所述方法对催化剂的处理量大、处理效果均匀，还避免了静态电化学表面处理中对电解质膜降解的问题。