本发明涉及分子生物学技术领域，尤其涉及一种鸭剩余采食量相关的microRNA分子标记及其应用。发明通过利用RNA‑Seq技术、生物信息学和基因表达分析方法，比较分析鸭高、低剩余采食量肝脏组织基因表达谱，鉴定筛选与剩余采食量及脂代谢相关的关键差异表达microRNA，结果显示miRNA‑1260‑5p与鸭的剩余采食量有关。本发明为肉鸭饲料利用率性状的选育和分子标记辅助育种提供重要的参考依据，在高饲料利用率鸭新品种和新品系分子育种方面具有广阔的应用前景。