本发明涉及动物饲料资源领域。针对烟草的烟碱含量高，无法作为动物饲料的问题，本发明提供一种低烟碱烟草的选育方法，并且提供所述低烟碱烟草的在动物饲料中的应用。所述低烟碱烟草由烟草品种K326和超低烟碱材料ULA‑Hi为亲本进行杂交，经过4代分离群体的分子标记筛选，获得了烟碱含量0.01～0.5％的低烟碱烟草ULA09XC21，并证明烟碱含量低于0.3％的低烟碱烟草能够作为动物饲料。得到所述的稳定低烟碱烟草品系的烟碱含量低于0.05％，所述低烟碱烟草是常规分子育种方法选育的非转基因烟草，所述低烟碱烟草用于饲喂家禽或家畜。