本发明涉及动物分子标记技术领域，是一种影响疆南绒山羊羊绒纤维直径性状的分子标记及其特异性引物对和应用，该影响疆南绒山羊羊绒纤维直径性状的分子标记位于疆南绒山羊1号染色体的KRTAP24‑1基因上，KRTAP24‑1基因位于1号染色体核苷酸序列的第4033765bp‑4034298bp处，所述分子标记位于1号染色体核苷酸序列的4034201bp处，突变碱基为C或T。本发明所述分子标记能够实现羊绒纤维直径性状优良品种种羊的早期选种，出生后即可进行选留，从而降低选育成本，加速高品质超细型疆南绒山羊的育种进程，为疆南绒山羊的遗传改良提供理论基础和指导。