本申请提供一种基于深度学习的光纤光栅传感系统降噪方法、电子设备及计算机可读存储介质，所述方法包括：对采集到的多条FBG反射信号样本进行预处理，得到多条第一FBG反射信号；向多条第一FBG反射信号中添加预设噪声，得到多组第二FBG反射信号，预设噪声包括器件干涉噪声、高斯白噪声、α稳定分布噪声及非平稳线缆风舞噪声中的至少一者；将多组第二FBG反射信号划分为训练集与验证集，以对深度学习降噪模型进行训练；基于训练完成的深度学习降噪模型对光纤光栅传感系统采集到的FBG反射信号进行降噪处理。本申请基于训练得到的深度学习降噪模型，可对受不同程度干扰的FBG反射信号进行去噪处理，鲁棒性高，去噪效果好。