本发明公开了一种耦合生境适宜模型的高效高精度栖息地模拟方法，采用矩形网格的高分辨率DEM地形，由已知条件赋值相关参数；基于Godunov格式中心有限体积法空间离散二维浅水方程，获取更高空间离散精度；由MUSCL重构和Runge‑Kutta法进一步实现时空的二阶精度；基于IFIM理论，采用适宜指数HSI构建生境适宜模型，以实现水动力过程与生境适宜模型的耦合；并引入GPU加速技术提高模拟效率。至此，耦合生境适宜模型的高效高精度栖息地模拟方法构建完成。本发明提高了生境模型中生境因子模拟精确性，为准确模拟河流水力特性和生物栖息地提供有效技术支撑，使之成为评价生物生境质量的有力工具。