本发明涉及一种智能型光伏玻璃温室及其运行方法和应用，属于玻璃温室技术领域，包括若干组南北方向并列设置的温室单元，若干组温室单元的棚顶框架形成W型，玻璃侧墙设置在温室主体框架的四周且非相邻温室单元连接处，朝南向棚顶框架上东西方向设置呈周期性安装的光伏板和Ⅰ型匀光板，每两组光伏板的中间设置一组Ⅰ型匀光板为一周期，Ⅱ型匀光板通铺在朝北向棚顶框架上。本发明通过玻璃温室主体框架、光伏板、Ⅰ型匀光板、Ⅱ型匀光板，保证该温室下部地面的光照强度为普通光照强度的70％左右，有助于减少地面水蒸发，而且保证光照处光照强度的均匀性，同时温室内安装有补光灯，通过“削峰填谷”式智能电路的调控，实现光伏发电与温室种植两不误。