本发明涉及一种水轮机调速器功率振荡判断方法和系统，该方法包括计算或获取如下参数：调速器功率给定、调速器功率反馈、调速器主配压阀阀芯位移、调速器功率死区，同时满足条件时，电力系统振荡导致机组发生功率振荡报警或者调速器系统振荡导致机组发生功率振荡报警。本发明能够自动准确判断出振荡源，不再需要人为进行统计分析；机组发生功率振荡调速器可自动进行应急处置，不再需要人为干预；增加了调速器功率给定、功率反馈、主配压阀阀芯位移参与控制的精度；增加了判断机组功率振荡的准确性。