本发明公开了一种提高粳稻三系不育系柱头外露率的复合药剂及其应用，该复合药剂包括：1.5‑2.5mg/L 6‑苄氨基嘌呤，1.5‑2.5mg/L激动素，4‑6g/L茉莉酸甲酯，250‑350mg/L赤霉素3，25‑35mg/L磷酸二氢钾，1.0‑1.4g/L硼砂，2.8‑3.2g/L二乙烯三胺。本发明采用6‑苄氨基嘌呤、激动素、茉莉酸甲酯和赤霉素3进行组合制得复合药剂，该复合药剂不仅安全无公害，而且可提高粳稻不育系柱头外露率可达13％以上，对提高杂交制种的结实率和产量具有显著效果；与清水对照相比，柱头外露提高近10％，杂交结实率提高近20％。