一种生物基聚碳酸酯的制备方法，包括：（1）向放置异山梨醇和催化剂的反应器中通CO2吹扫，然后通入超临界CO2流体，调节反应器内温度和压力，保持CO2为超临界状态，各反应物进行预聚反应；（2）向反应体系内持续通入CO2，并使CO2持续流出，维持反应体系内压力恒定，使各反应物继续进行终聚反应；（3）冷却，加入二氯甲烷溶解产物，过滤，将滤液加入到乙醇中，过滤得到的沉淀物即为所述生物基聚碳酸酯。本发明利用超临界CO2具有较高的反应活性、扩散系数和溶解能力，将CO2作为反应物，同时作为溶剂，更容易将副产物水溶解并带出，在终聚反应阶段使聚合反应正向进行，有利于分子链的增长，得到分子量大的聚碳酸酯产物。