本发明公开了一种基于kDBA聚类的谐波污染分区方法，涉及电力系统领域，包括：采集配电网各监测节点的谐波电压，并对采集的数据进行缺失值填充和归一化处理，得到谐波电压序列集；设定聚类的类别数目k，从谐波电压序列集中随机抽取k条谐波电压序列，作为聚类中心集的k个初始序列；以谐波电压序列集的各谐波电压序列与聚类中心集的各谐波电压序列的动态弯曲距离作为度量指标，通过质心平均算法迭代聚类中心集，直至迭代收敛；对谐波电压序列集中的谐波电压序列进行谐波污染分区。本发明利用基于波形相似性的聚类思想，使区域内节点污染关联性强、区域间关联性弱，可应用于随时间变化特征明显的电能质量指标，不限于特定的谐波电压指标。