本发明提出一种抽水蓄能机组协同控制低电压穿越系统及其方法，属于低电压穿越技术领域。检测单元包括机侧和网侧处的检测器和直流侧检测器；所述机测和网测处检测器；所述过压辅助支路包括转换开关S3、双向DC/DC变换器和超级电容，并联设置在直流母线电容侧，双向DC/DC变换器采用半桥结构，前级连接转换开关S3，后级连接超级电容，超级电容设置在双向DC/DC变换器两个开关管的中心点；所述双阻抗替代模块包括转换开关S1和转换开关S2，其中转换开关S1一端连接网侧变流器，另一端连接变压器连接线，转换开关S2一端连接机侧变流器与转子连接线，另一端连接网侧变流器与变压器。本发明解决了控制难度大缺乏灵活性问题。