本发明公开了一种短时训练卷积神经网络的心电信号分类方法，包括如下步骤：载入数据库中的心电信并进行去噪，得到去噪后的心电信号；对心电信号进行R波检测并截取QRS波所处的心拍段；根据数据库中心拍标签对截取的心拍段进行分类，得到心拍矩阵和与之对应的标签矩阵；利用小波变换对心拍矩阵进行特征系数提取得到特征矩阵；对特征矩阵进行随机切分得到训练集心拍和测试集心拍，并根据标签矩阵生成训练集心拍对应的标签矩阵和测试集心拍对应的标签矩阵；建立卷积神经网络，利用训练集和测试集对建立的网络进行训练与测试，得到心电信号分类结果的准确率。本发明在保持准确度较高的情形下，降低消耗时间，提高了算法的实时性。