本发明属于智能农机机械设备技术领域，公开了玉米育种试验收获用风力输送清选系统、控制方法及应用。智能监测控制系统用于监测风力送风、机器运行状态是否异常，并将监测的异常信息进行报警；种子风力输送系统通过改变吸附力的大小将收集的不同量的种子零残留输送到种风分离测产系统；种子分离测产装置将清选分离和测产后的种子下发至种子换向集粮系统，种子经换向集粮系统输送至用于种子存储的粮箱装置。本发明实现了风力输送零残留输送，不混种；实现了溢出堵塞报警，减少了小区报废；实现了零残留风选。