本发明公开了一种靶向新冠病毒的纳米抗体及其制备方法和应用，所述纳米抗体包括纳米抗体NbN2、纳米抗体NbN3、纳米抗体NbN4、纳米抗体NbN5、纳米抗体NbN6、纳米抗体NbN11中的至少一种，提供的纳米抗体对新冠病毒野生株、新冠病毒变异株阿尔法（Alpha）、新冠病毒贝塔（Beta）、新冠病毒德尔塔（Delta）、新冠病毒Omicron及其亚型BA.2的RBD结构域具有较高的亲和力，能够快速且特异性地中和不同的新冠病毒，有效抑制其活性；同时，提供的纳米抗体具有更长的CDR3序列，有利于纳米抗体进行灵活调节其构象，提高与病毒的结合作用，有利于广泛应用。