本发明公开了一种与玉米抗灰斑病主效QTL紧密连锁的分子标记，所述玉米抗灰斑病主效QTL是位于玉米第1号染色体Bin1.02位置，命名为QTLqGLS1.02，与其紧密连锁的分子标记为COP‑M1，所述COP‑M1的物理位置：Chromosome1:23820258‑23820275。本研究首次在玉米1号染色体抗灰斑病主效QTL开发一个分子标记COP‑M1。本发明中玉米抗灰斑病的主效QTL点位置明确，贡献率较高，能显著改善玉米自交系材料的抗病性状，检测方法方便快速，能够有效用于灰斑病抗性材料的鉴定与商业化感病品种的改良。