本发明公开了一种发电机组控制器与上位机的通讯方法，包括：多个上位机组成的上位机控制终端群与发电机组控制器接入CAN总线；上位机控制终端群生成控制指令集合，任一上位机将控制指令集合中的命令封装为CAN协议帧格式并经CAN总线发送至发电机组控制器；发电机组控制器接收CAN协议帧格式的命令帧做出响应后回复命令帧，并设置错误码；发电机组控制器自主上传数据信息和报警信息，并将数据信息和报警信息封装为CAN协议帧格式；上位机控制终端群接收经CAN总线传输的发电机组控制器回复的命令帧、错误码、数据信息和报警信息，并进行同步。本发明能实现长距离传输，且传输效率高，能保证在同一时刻网络上所有节点侦测的数据是一致的。