本发明公开了一种渔稻互作的水产养殖系统和水产养殖方法，所述方法包括在池塘中间设置隔断，所述隔断将所述池塘分隔为第一种植区(2)和第二种植区(3)；所述隔断的一端与所述池塘的侧壁之间设置有用于水产养殖的流水槽(1)，所述隔断的另一端设置有回流通道(4)；在所述第一种植区和所述第二种植区种植水稻，并且在所述流水槽(1)中养殖鱼类；并且形成从所述第一种植区经过所述回流通道(4)进入所述第二种植区再经过所述流水槽(1)进入所述第一种植区的循环水流。本发明将池塘工业化生态养殖与水稻种植完美结合，降低水稻种植的肥料消耗，提升了水产养殖经济效益，从根本上解决了水产养殖水体富营养化的污染问题。