本发明公开了一种强烈构造发育区盖层封闭性能评价方法及装置，该方法包括：基于需要判别的盖层岩石样品判断盖层岩石样品是否具备静态下的封闭油气能力；若具备，则获得盖层不同埋藏深度下对应的地层温度和围压；以盖层不同埋藏深度下对应的地层温度和围压为三轴应力测试条件，对盖层岩石样品进行气‑固耦合下样品气测渗透率值的测定，获得盖层岩石样品的渗透率变化图和应变图；基于渗透率变化图和应变图，识别渗流状态临界点；基于渗透率变化图、应变图和渗流状态临界点，构建三轴应力测试条件下的盖层封闭有效性判别图；基于所述盖层封闭有效性判别图进行强烈构造发育区盖层封闭性能评价。本发明可以有效的评价盖层质量。