本发明提出一种基于多物理特征的主动目标识别方法，首先通过初筛快速筛选出疑似目标，然后对疑似目标进行径向速度、径向尺度、多回波相似度、亮点结构、调频回波子带相关性、回波相位等多物理特征提取，根据专家知识构建综合判别准则，最后通过模糊逻辑分类系统实现对水下目标高置信度识别。本发明提出的初判与精判相结合的探辨一体化主动目标识别方法，可有效解决主动声呐高虚警问题，显著提升探测效能；同时通过互补性和关联性地运用目标多物理特征，有效提高了目标识别正确率和宽容性。