本发明属于太阳能混合发电技术领域，具体提供了一种光伏光热互补发电系统优化配置方法，包括如下步骤：搭建子系统模型，对子系统模型的边界条件进行梳理，并设置子系统模型在时间序列上的运行限制条件；设置子系统的优化目标；应用群体智能算法对子系统的变量进行编码，编码后通过子系统模型进行仿真，基于仿真结果获得子系统适应度函数；根据子系统的目标，将子系统适应度函数进行迭代寻优；判断迭代寻优是否终止，根据优化后的子系统适应度函数对子系统进行配置。解决了现有光热发电系统不能实现系统的最优配置的问题，本发明能够实现光伏光热系统合理的技术配置，使光热电站的参数配置能够满足系统调峰的需求。