本发明公开了一种车载复合电源用高压配电单元及其控制方法，其结构上包括电源配电回路、负载配电回路、绝缘检测回路、传感器、高压控制单元等；其控制方法通过复合电源系统回路单独控制及并联耦合，实现系统高冗余度，通过高压接触器反馈信号及连接器反馈信号等实现系统实时状态监控及故障诊断，通过系统分步式上电控制实现系统绝缘检测，同时具备回路电流检测等功能。该技术方案，可实现匹配复合电源的纯电动、混合动力、燃料电池等车辆高安全性、高冗余性高压配电及控制。