一种用于多糖提取的磁性分子印迹聚合物的制备方法及其应用，属于聚合物吸附材料领域。本发明的目的是为了解决多糖提取过程步骤繁琐，多糖分子印迹聚合物吸附量和印迹因子低等问题，所述方法为：将4‑乙烯基苄氯和无水乙醇混合，加入30％的三甲胺乙醇溶液在20～40℃反应1～24h，得到4‑乙烯基苄基三甲基氯化铵白色晶体；将海带多糖与4‑乙烯基苄基三甲基氯化铵，搅拌预聚合1h，然后加入Fe3O4@AA和交联剂N，N’‑亚甲基双丙烯酰胺，再加入过硫酸铵，70℃反应10h即可。本发明制备的磁性分子印迹聚合物可应用于实际海带多糖的提取，极大的节约了时间，简化了海带多糖的提取步骤。