本发明公开了一种与凡纳滨对虾抗副溶血弧菌感染相关的几丁质结合蛋白基因上的SNP标记及其应用。所述的SNP标记位于如SEQ ID NO.1所示的凡纳滨对虾几丁质结合蛋白基因序列的501bp位点处，突变类型为T纯合、T/A杂合和A纯合，该标记的抗副溶血弧菌感染优势基因型为T纯合。本发明同时公开了利用上述标记进行抗副溶血弧菌感染性状标记辅助育种的应用方法。本发明提供了一种有效地开展凡纳滨对虾分子标记辅助抗副溶血弧菌感染性状遗传选育的方法，该方法效率高，操作简单，选育个体基因型稳定，不发生遗传分化，可显著加快抗病育种进展，对提高凡纳滨对虾抗病养殖具有重要指导意义。