本发明提一种WMS处理后信号的噪声处理方法，包括以下步骤：对二次谐波信号中的噪声信号进行处理；对二次谐波信号进行重构；对二次谐波信号中的噪声信号进行多次迭代；得到二次谐波信号处理解后，计算出残差；相较于传统去噪方法，本发明在L1R的稀疏处理方法去噪过程中，引入逐次迭代的方法，对含噪声信号的二次谐波信号进行逐次去噪处理，有效去除二次谐波信号中的噪声信号，并配合阈值收缩方法，不给定固定的迭代阈值，而是根据信号去噪过程自动调整阈值，对二次谐波中的噪声信号进行最大去除。