本发明属于燃料电池金属双极板领域，尤其涉及一种用于金属双极板的防护涂层及其制备方法。所述防护涂层覆盖于金属双极板基体表面，所述防护涂层包括过渡层和非晶碳层，所述非晶碳层覆盖于所述过渡层，所述过渡层与金属双极板基体结合，所述过渡层的组分包括Ti和Cr中至少一种。过渡层的设计可提高金属双极板表面防护涂层的结合可靠性，非晶碳层导电性和耐腐蚀性良好，且能解决金属双极板表面氧化导致导电性变差的问题，最终能够使金属双极板的平均腐蚀电流密度小于0.03μA/cm2(恒电位极化0.6V下保持24小时)、界面接触电阻小于2mΩ·cm2(1.4MPa下)。