本发明公开了一种基于淹水频率的河湖湿地植物修复区域优选方法，包括以下步骤：S1、根据河湖支流流量等数据，建立河湖水动力数学模型；S2、采用河湖水动力数学模型，计算各个网格的淹水频率；S3、根据各个网格的淹水频率，对河湖水域和河湖湿地植物修复区域分别进行分区，得到各个网格的河湖水文分区和湿地植物修复分区类型；S4、根据各个网格的河湖水文分区和湿地植物修复分区类型，绘制基于淹水频率的河湖湿地植物修复分区图；S5、根据河湖湿地植物修复分区图，在不同修复分区种植相应的河湖湿地植物；本发明解决了现有缺乏一种对河湖湿地植物修复区域进行定量化优选的方法的问题。