本发明涉及药物‑靶点相互作用预测技术、深度学习领域，具体为一种基于图卷积和相似性的药物‑靶点相互作用预测算法。包括：1)通过DrugBank和RCSB等公开数据库获取药物、蛋白质和DTI相关数据；2)通过全局结构相似性提取分子间结构信息；3)通过DeepChem提取药物分子和蛋白质分子的单体特征信息；4)通过特征降维、特征融合和归一化处理得到药物‑靶点相互作用预测结果；5)对模型进行参数调优，不断提升预测准确率，最优模型将用于辅助药物发现、药物验证和药物副作用等研究。