本发明为一种基于虚拟同步机的储能电站黑启动方法及系统，为克服传统黑启动微源容量有限且分布不均匀的问题，通过设定配电变压器一次侧的电压，在忽略磁通暂态分量衰减的条件下计算得到配电变压器铁芯磁通的最大值，在保证储能电站快速黑启动以及变压器铁芯在整个启动过程中不饱和状态的条件下，得出储能电站零压软启的时间；基于虚拟同步机，确定单个储能单元的控制策略以及多个储能单元之间的预同步控制策略；根据储能电站中不同储能单元的荷电状态，确定多个储能单元的协同控制策略。本发明方法摒弃了将传统的水电、火电等直接作为黑启动电源，充分发挥储能电池的优势将其作为黑启动微源，为大停电后电网的快速恢复提供了一种新方案。