本发明公开了一种多通道注意力图神经网络聚类的单体程序拆分方法及系统，包括单体程序多属性图构建、多通道图神经网络特征嵌入表示学习、基于注意力的多通道特征嵌入融合、基于谱聚类的微服务拆分。通过图神经网络重构信息和聚类信息构建新的损失函数，实现了图注意力神经网络与聚类的联合学习框架，实现了提取微服务在功能性和模块性方面性能的提升。本发明结合单体程序多种属性信息，构建多通道图注意力网络，实现了更为高质量的特征嵌入表示，同时也提升了微服务提取方法的可扩展性，避免了微服务提取方法在应用中使用受限等问题。