本发明公开了一种船舶靠泊作业防疫管理方法及管理系统，属于防疫管理技术领域。其中，防疫管理方法通过“一派单任务一防疫监控管理”的方式，实现了对执行每个派单任务的作业人员出入专班宿舍、在船舶作业以及船员是否出入生活舱的闭环管理，减少了作业人员与无关人员接触的可能，使得对于船舶靠泊作业的防疫管理工作更加精细化、更有针对性，且当出现防疫异常事件时，便于后续针对每个派单任务进行责任的快速响应追溯。提供的防疫管理系统中的船舶生活舱单兵监控装置不用再接入市电，安装方便、快捷，灵活度高，便于单兵携带使用。