本公开属于配电网技术领域，提供了一种多层级协同补偿的配电网无功平衡优化降损方法及系统，包括以下步骤：获取用户补偿层的总无功缺额和配电台区层的配变侧总无功缺额；计算配电线路层的总无功需求；确定主变电层的最大无功缺额，补偿配电网的无功损耗。本公开各级无功补偿优先考虑本层级的无功就地平衡，兼顾变电站层、配电线路层、配电台区层、用户补偿层四个配电网层级之间的协同配合，在配电网各电压等级间形成四级联动，最大程度实现无功就地平衡优化，减少配电线路上无功功率的流动，有效实现配电网降损。