本发明公开了一种应用感知的多租户Coflow调度方法和系统，包括采集Coflow流量信息；根据Coflow流量信息构建NHPP排队模型，模拟Coflow流量信息，建立租户到达模型；求解租户长期隔离进度，使Coflow达到租户长期隔离进度，实现租户隔离与应用感知；对Coflow调度问题进行建模，通过拉格朗日对偶优化，求解性能最优进度，以实现最小化Coflow完成时间和最大化实际分配带宽；得到租户进度的取值范围，实现应用感知的多租户Coflow调度。本发明结合分布式并行计算框架中Coflow特点，通过数学建模加入应用感知机制，保证租户带宽隔离；通过对偶优化，增大租户的实际带宽，提高网络链路利用率。