一种巯基嘧啶衍生物季铵盐缓蚀剂及其制备方法和应用，属于新型材料技术领域。巯基嘧啶衍生物缓蚀剂的分子结构式如式Ⅰ。巯基嘧啶衍生物缓蚀剂的制备方法包括：(1)称取4‑乙烯基苄基三甲基氯化铵与溴化氢，加入过氧化物催化剂，进行反马氏加成反应，提纯生成含有阳离子官能团的α‑卤代烃；(2)称取含有阳离子官能团的α‑卤代烃与4,6‑二氨基‑2‑巯基嘧啶，在碱性溶液中进行亲核取代反应，提取获得阳离子季铵盐缓蚀剂。本发明巯基嘧啶衍生物季铵盐缓蚀剂制备方法，简单易行，缓蚀性能优良。本发明缓蚀剂分子中氮正阳离子、硫原子以及含有丰富的氮原子，缓蚀效果明显，适用于油气开采过程中的腐蚀防护。