本申请提供一种磁盘处理方法、系统及电子设备：监测到磁盘告警信息时，标记对应的告警磁盘为故障磁盘；检测故障磁盘对应的磁盘组的状态；若磁盘组状态为降级，标记故障磁盘为隔离磁盘并生成报警信息；若磁盘组状态为健康，则判断是否存在冗余磁盘组；若不存在冗余磁盘组，则根据第一预设规则对故障磁盘进行操作并生成报警信息；若存在冗余磁盘组，检测冗余磁盘组状态，若冗余磁盘组状态为健康，则标记故障磁盘为隔离磁盘并生成报警信息，否则根据第二预设规则对故障磁盘进行操作并生成报警信息。通过对告警磁盘有选择的进行隔离，避免告警磁盘后续出现故障造成影响，提高一体机读写性能的稳定性；保证数据的安全性及连续性，消除数据丢失风险。