本发明公开一种基于有向图的代码仓库Java冲突文件排序分组方法：首先，对不同分支上的所有Java文件根据文件之间的依赖关系构造出依赖关系图；其次，将不同分支上的图进行合并，得到合并后的依赖关系图；然后，遍历合并后的依赖关系图，将节点所携带的文件全路径名与发生冲突的Java文件的全路径名进行对比，将比对相同的按照节点序号从大到小将Java文件的全路径名保存；接着，将处在同一个依赖关系图中的Java文件分入到同一分组。能够有效地针对当前代码仓库存在的大量冲突有效的进行排序，同时对发生冲突的文件进行有效的分组从而帮助开发人员有序的解决冲突。