本发明公开了一种楼体变形缝顶端屋顶面防水结构层的施做方法，解决了现有的结构存在的整体美观性差和防水效果不佳的问题；在变形缝（3）顶端口上设置有U形镀锌铁皮托（6），在左侧屋顶面基层（4）、U形镀锌铁皮托（6）和右侧屋顶面基层（5）上，设置有防水卷材（7），在U形镀锌铁皮托（6）的U形槽中的防水卷材（7）上填充有弹性泡沫棒（8），在弹性泡沫棒（8）的顶端面、和变形缝（3）左右两侧的防水卷材（7）上设置有防水附加层（9），在变形缝（3）正上方的防水附加层（9）上设置有丁基密封胶层（13），在变形缝（3）左右两侧的防水附加层（9）上均设置有找平结合层（11）；有效提高了防水施工质量。