本发明公开了一种水文地质测量仪器用智能保护装置，包括对测量仪器本体侧面进行清洁的刮板一以及对测量仪器本体上表面进行清洁的刮板二，所述刮板一的侧面固定连接有对其进行往复推动的齿板，所述齿板下表面上的齿牙啮合有传动齿轮，所述传动齿轮的内壁固定连接有由外接动力机构带动转动的轴一，所述刮板二的侧面固定连接有带动其往复滑动的滑块。本发明，通过上述结构之间的配合使用，解决了在实际使用过程中，由于在水下长期浸泡过程中，会使仪器的表面整体附着大量的水垢，水垢的积累容易影响后期测量精度的准确性，以及会加速仪器的老化，给使用带来不便的问题。