本发明公开了一种PSG数据自动分析方法、装置、计算机设备以及存储介质，涉及睡眠分析技术领域；方法包括步骤：S10、原始数据的采集，该原始数据包括生理信号数据和睡眠分期标签数据；S20、数据的预处理；S30、睡眠分期预测模块对数据的处理，经预处理的数据输入至睡眠分期预测模块，其处理过程包括通过特征提取模块对输入数据的特征提取的步骤、对提取的特征采用特征融合模块进行特征融合得到特征向量的步骤、将特征向量与编码向量融合得到新的特征向量的步骤以及将新的特征向量输入Transformer模块得到当前帧的睡眠分期结果的步骤；本发明的有益效果是：提高了医师分析病人整夜PSG信号的效率，提高患者就诊的效率。